Los organismos adaptados a la vida en altitudes elevadas se ven particularmente amenazados por el cambio climático, que puede provocar que queden aislados en las cimas de las montañas; sin embargo, sus respuestas pueden variar según su posición en la cadena alimentaria y su flexibilidad ecológica. Predecir las distribuciones futuras de tales organismos requiere modelos ajustados específicos de cada especie. Sobre la base de un modelo de nicho ecológico anterior, exploramos cambios en la idoneidad de los hábitats para el gato andino en peligro de extinción Leopardus jacobita, y evaluamos cómo estos estarán representados dentro de las áreas protegidas existentes en el futuro. Utilizando un conjunto sólido de registros de presencia y superficies climáticas corregidas, aplicamos el algoritmo de Maxent para modelar la idoneidad del hábitat para este carnívoro y su presa preferida, la vizcacha de montaña Lagidium viscacia. Nuestras predicciones indican que las áreas climáticamente adecuadas para los gatos andinos podrían contraerse hasta un 30% para 2080 en el escenario más pesimista, con un desplazamiento general hacia arriba de 225 m y un desplazamiento hacia los polos de 98 a 180 km. La contracción prevista del área de distribución fue más pronunciada en el área de distribución principal de la especie, en los Andes bolivianos y peruanos, mientras que las condiciones adecuadas pueden aumentar en la zona de distribución sur de la Patagonia. Se prevé que Bolivia y Perú sufrirán la disminución más marcada en la representatividad del hábitat dentro de las áreas protegidas. La cordillera del sur parece ser menos vulnerable al cambio climático, lo que ofrece oportunidades para la conservación de esta población genéticamente distinta. Discutimos el valor y las limitaciones de utilizar modelos de distribución de especies para evaluar cambios en la distribución potencial y el estado de conservación de esta y otras especies andinas.